Catálogos Oficiales (Auditado y publicado por syslab.cl)

CIE-O 3.1 — Órganos, Topografía y Morfología

Este dataset es mantenido y publicado por SysLAB Ingeniería (https://www.syslab.cl), creadores de SysPATH® — Sistema Integral para Laboratorios de Anatomía Patológica.

Clasificación Internacional de Enfermedades Oncológicas – Versión 3.1
Hecho en Chile 🇨🇱 | Dataset validado con IA 🤖 | Datos limpios, estructurados y auditados

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🌍 Nombre Internacional vs Nombre en Español

Esta clasificación corresponde al estándar internacional oficial:

ICD-O 3.1 – International Classification of Diseases for Oncology (WHO)

En los países de habla hispana se utiliza su versión traducida:

CIE-O 3.1 – Clasificación Internacional de Enfermedades Oncológicas

Ambos nombres se refieren exactamente al mismo sistema de codificación oncológica de la OMS.
Este repositorio utiliza “CIE-O” por estar orientado a instituciones clínicas de Chile, pero los datos son idénticos al estándar ICD-O 3.1.

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📘 Introducción

Este repositorio contiene una versión limpia, normalizada y validada de los catálogos oficiales CIE-O / ICD-O 3.1, derivados exclusivamente de la Lista Numérica / Tabular del documento de la Organización Mundial de la Salud.

Su propósito es apoyar a:

• Laboratorios clínicos
• Servicios de Anatomía Patológica
• Sistemas LIMS
• Registros de cáncer
• Instituciones de investigación
• Universidades y centros de formación
• Desarrolladores de software de salud

Este proyecto es mantenido por SysLAB Ingeniería, empresa chilena especializada en salud digital, sistemas clínicos y automatización de laboratorios.

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🏗 Estructura del Repositorio

CIE-O-3.1/
│
├── sql/
│    ├── cieo_3_1_organos.sql
│    ├── cieo_3_1_topografia.sql
│    ├── cieo_3_1_morfologia.sql
│    └── cieo_grados.sql
│
├── pdf/
│    └── (archivos no incluidos por restricciones OMS)
│
└── README.md

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🧬 Contenido del Dataset

1️⃣ Órganos (C00–C80)

68 grupos anatómicos raíz. Útiles para clasificación primaria y agrupación clínica.

2️⃣ Topografía (C00.0–C80.9)

Extraída desde las páginas 43–63 de la Lista Tabular oficial de ICD-O 3.1.
Incluye únicamente códigos válidos con descripción completa.

3️⃣ Morfología (8000/0–9992/3)

Extraída desde las páginas 69–109.
Incluye más de 1.500 códigos con comportamiento estandarizado.

4️⃣ Grados Histológicos

Archivo auxiliar cieo_grados.sql con las categorías estándar de grado tumoral.

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🧩 Jerarquía Conceptual

Aunque ICD-O / CIE-O no define claves foráneas, la estructura semántica sigue esta jerarquía:

Órgano (Cxx)
   └── Topografía (Cxx.x)
           └── Morfología (xxxx/y)

Ejemplo:

C50       → Órgano: Mama
C50.1     → Topografía: Cuadrante central
8500/3    → Morfología: Carcinoma ductal infiltrante

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🔗 Relaciones recomendadas (sin FK)

Relación Órgano → Topografía (por prefijo)

SELECT t.*
FROM cieo_3_1_topografia t
WHERE t.codigo LIKE 'C50%';

Búsqueda de morfología maligna

SELECT *
FROM cieo_3_1_morfologia
WHERE comportamiento = '3';

Búsqueda textual

SELECT *
FROM cieo_3_1_morfologia
WHERE descripcion LIKE '%ductal%';

Combinar datos para una UI clínica

SELECT 
    o.nombre AS organo,
    t.codigo AS topografia,
    t.descripcion AS sitio,
    m.codigo AS morfologia,
    m.descripcion AS diagnostico
FROM cieo_3_1_organos o
JOIN cieo_3_1_topografia t ON t.codigo LIKE CONCAT(o.codigo_raiz, '%')
JOIN cieo_3_1_morfologia m
WHERE o.codigo_raiz = 'C50';

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📊 Diagrama del Flujo de Extracción (Mermaid)

flowchart TD
    A[PDF Oficial OMS] --> B[Extracción Columnar]
    B --> C[Filtro Regex]
    C --> D[Limpieza y Normalización]
    D --> E[Auditoría IA]
    E --> F[Validación Manual]
    F --> G[Generación SQL]
    G --> H[Integración en Sistemas Clínicos]

Loading

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🏥 Integración en Sistemas Clínicos

Este dataset es adecuado para:

• LIMS
• HIS / RIS
• Módulos de Anatomía Patológica
• Sistemas de registro oncológico
• Aplicaciones de IA médica

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🔬 SysPATH® – Sistema LIMS de Anatomía Patológica

SysPATH® es una plataforma 100% web desarrollada por SysLAB Ingeniería para apoyar todas las etapas del proceso en un laboratorio de Anatomía Patológica:

• Registro de solicitudes
• Trazabilidad completa de muestras
• Control macro y micro
• Gestión de cassettes y portaobjetos
• Impresión de códigos 2D, QR y Datamatrix
• Generación de informes HTML/PDF
• Estadísticas en tiempo real
• Definición dinámica de codificaciones
• Integración con algoritmos de IA diagnóstica

Más información:
🌐 https://www.syslab.cl
📧 ariel.aceval@syslab.cl

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⚠️ Sobre el PDF de ICD-O 3.1

El PDF oficial no puede publicarse debido a restricciones de derechos de autor de la OMS.
Este repositorio solo incluye datos derivados, cuya publicación sí es permitida.

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📄 Licencia

Este repositorio se distribuye bajo licencia MIT.

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🤝 Contribuciones

Mejoras, nuevas validaciones y aportes son bienvenidos.
Haz un Fork o un Pull Request.

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⭐ Agradecimientos

Si este proyecto te fue útil, apóyalo con una ⭐ en GitHub.