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L'obiettivo di questa pipeline è quello di avere una classe per valutare la bontà di diversi subset di keygenes (e quindi dei loro criteri di selezione) su diversi modelli di classificazione.

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mattiamanna2203/EvaluateKeyGenes

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Una repository contenente una classe per costruire una pipeline atta a valutare i subset di keygenes ed i loro metodi di selezione. La valutazione avviene tramite l'analisi delle metriche di performance.

I file:

  • EvaluatePipeline.py contiene la classe Python;

  • Nel folder HandmadePackages contenente le classi e le funzioni di ausilio da me create per la classe contenenuta in EvaluatePipeline.py;

    • evaluate_performance: Contiene diverse funzioni per misurare le performance di diversi tipi di modelli di classificazione.
    • LaTeX: classe per la creazione di report pdf in python.
    • preprocessing: Funzioni per il preprocessing, ad esempio semplificare la ricodifica di variabili qualitative.
  • tryme.ipynb Python notebook, esempio base per utilizzare la classe Python creata;

  • Esempio applicazione pratica.ipynb python notebook che contiene un esempio di applicazione reale della classe affiancata dalla classe LaTeX per la creazione del report finale;

  • Report esempio applicazione pratica.pdf report proveniente dallo script descritto nel punto precedente;

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L'obiettivo di questa pipeline è quello di avere una classe per valutare la bontà di diversi subset di keygenes (e quindi dei loro criteri di selezione) su diversi modelli di classificazione.

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