macro muscle
avant d'utiliser la macro :
- reconstruction de la mosaique avec le plugin grid collection stitching
- attention l'image n'est plus étalonnée TODO: ajouter une ligne à la macro run("Properties...", "channels=2 slices=3 frames=1 unit=um pixel_width=0.3244015 pixel_height=0.3244015 voxel_depth=1");
- l'image comporte 2 canaux (ch1=green, ch2=red) et 3 slices
- requirements : Tubeness plugin : https://longair.net/edinburgh/imagej/tubeness/
macro SelectionToBand
process image before
-
spot-detector/colocalization in Icy -
or Mitobo/particles2D in Fiji