はじめに

このディレクトリは、 aiida と QE を用いて Wannier 化を行うチュートリアルです。

python 環境設定

conda 24.9.2, python 3.12.8 を使用。

conda env remove -n aiida
conda create -n aiida python=3.12
conda activate aiida

pip install aiida-core
conda install -c conda-forge aiida-core.services
rabbitmq-server -detached
verdi profile setup core.sqlite_dos
verdi profile configure-rabbitmq

あるいは

conda env remove -n aiida
conda env create -f environment.yml
conda activate aiida

aiida 環境設定

~/.aiida ディレクトリを作り、ここにグローバル設定やSQLデータベースを保存する。

プロジェクトごとにプロファイルを作る。 ここでは aiida_test プロファイルを作る。メールアドレスは入力必須。 デフォルトにしておく。

rabbitmq-server -detached
verdi profile setup core.sqlite_dos
verdi profile set-default aiida_test
verdi profile configure-rabbitmq
verdi profile list

brokerがエラーを吐く場合、

rabbitmqctl stop
rabbitmq-server -detached

をもう一度やる。

注意

簡単のためにSQLiteを用いるが、複数の計算を同時に行う場合にはPostgreSQLを用いる必要がある。 PostgreSQLを用いる方法についてはまた別の機会に。

デーモンの起動

verdi daemon start
verdi status

注意

以下のようなWarningが出る。

Warning: RabbitMQ v3.12.13 is not supported and will cause unexpected problems!
Warning: It can cause long-running workflows to crash and jobs to be submitted multiple times.
Warning: See https://github.com/aiidateam/aiida-core/wiki/RabbitMQ-version-to-use for details.

これはデフォルトではデーモン(RabitMQ)が30分以上のジョブを監視してくれないことを意味する。 監視時間を無限にする方法はまた別の機会に。

擬ポテンシャルの設定

aiida-pseudo install sssp
aiida-pseudo list

Full relrativisticなポテンシャルがほしいときには、オプションで指定する。

aiida-pseudo install pseudo-dojo -x PBE -r FR -f upf

参考文献

https://eminamitani.github.io/website/2021/03/25/aiida_2/