PROJETO AGSSA

Table of Contents

• Sobre
• Começando
• Usando

Utilizando com o docker

  docker compose up --build -d 

Para utilizar sem usar o docker, segue as intruções abaixo

Começando

Instruções para instalação e execução do projeto.

Pré-requisitos

O que você precisa para instalar o software e como instalá-lo.

• 3.12.3
• RabbitMQ (sudo apt install rabbitmq-server)
• Alinhamento das Sequências
  • Golang (https://go.dev/doc/install)
  • Minimap2 (https://github.com/lh3/minimap2?tab=readme-ov-file#installation)
  • Gofasta (https://github.com/virus-evolution/gofasta?tab=readme-ov-file#installation)

Executando

Criando o ambiente virtual:

python3 -m venv venv

Ativando o ambiente virtual:

source venv/bin/activate

Instalando as dependências:

pip install -r aplicacao/requirements.txt

Criar arquivo .env com as infos que estão no arquivo .env.example

Executando o celery:

celery -A app.celery worker --loglevel=info

celery -A beat_app.celery beat --loglevel=info

Executando a aplicação para desenvolvimento:

flask --app app run --debug

Usando

Ao executar o projeto o mesmo será executado em http://localhost:5000