Escuela de Bioinformática 2021

A2B2C - Fundación Instituto Leloir

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Introducción a Python para Bioinformática

1, 2, 3, 4 y 5 de Marzo de 2021. Clases teórico practicas de 10 a 13 Hs. (GMT -3) Resolución de ejercicios de 13 a 16 hs (por cuenta del alumne, sin conexión). Resolución de dudas y ejercicios de 16 a 17 hs. Docentes: Javier Iserte, Fernando Orti, Elizabeth Martinez Perez (Fundación Instituto Leloir)

OBJETIVOS:

El curso busca ofrecer un primer acercamiento a la programación, el manejo y la visualización de datos, utilizando el lenguaje Python.

AUDIENCIA:

El curso está pensado para investigadorxs, estudiantes de grado y posgrado que tengan interés en hacer sus primeros pasos en la programación en general y/o que busquen incorporar la programación en sus labores profesionales.

DIAS Y HORARIOS:

1, 2, 3, 4 y 5 de Marzo de 2021. Clases teórico practicas de 10 a 13 Hs. (GMT -3) Resolución de ejercicios de 13 a 16 hs (por cuenta del alumne, sin conexión). Resolución de dudas y ejercicios de 16 a 17 hs.

DOCENTES:

Dr. Javier Iserte, Lic. Fernando Orti, Lic. Elizabeth Martinez Perez

CONTENIDOS GENERALES

• Generalidades del lenguaje Python.
• Herramientas para empezar a programar.
• Sintaxis del lenguaje:
  • Tipos de datos
  • Operadores
  • Listas y diccionarios
  • Estructuras de control de flujo
  • Funciones
• Introducción a Clases y Objetos.
• Bibliotecas
• Manejo y procesamiento de texto.
• Expresiones regulares.
• Manejo y procesamiento de tablas con Pandas.
  • Lectura y escritura de archivos.
  • Operaciones básicas con tablas.
  • Filtrado, agrupamiento y reshaping de datos.
  • Manejo de datos faltantes.
• Estadística básica.
• Gráficos exploratorios.
• Bonus: Presentación de algunas herramientas bioinformáticas disponibles en Python.

CERTIFICADOS:

Se tomará un examen no obligatorio al finalizar el curso y se emitirá certificado de aprobación con nota. Se emitirán certificados de participación para aquellas personas que no rindan el examen

REQUISITOS MÍNIMOS:

Computadora para uso personal Conexión a Internet No se requiere conocimientos previos de programación. En el curso vamos a programar utilizando la plataforma COLAB de Google (https://colab.research.google.com/notebooks/welcome.ipynb?hl=es). Por este motivo es altamente recomendable que tengan una cuenta de Google para poder utilizarlo. Igualmente las clases y ejercicios se pueden realizar utilizando cualquier otro entorno de programación Python que cada unx prefiera.