Иметь отдельный класс под каждый тип таблицы неудобно и плохо скейлится, поэтому предлагаю заменить класс SensitiveBase на декоратор @sensitive, который будет устанавливать аттрибуты на Base.
Так же стоит расширить класс Base, чтобы он позволял добавлять кастомные __table_args__, даже если под это нет декторатора (соответствующий метод в Base будет проверять наличие аттрибута наподобие __table_args_custom__ на классе, и если он есть, мёрждить их в то, что он возвращает, через какой-нибуь dict.update)
Всё это вообще нужно, чтобы по аналогии с @sensitive добавить декторатор @encrypted.