runner/started.img at master · ivister/runner · GitHub

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
# Это комментарий
# Следующая строка - название секции
[General]
# Далее идет содержимое секции
# Следующая срока определяет имя задачи
task_name = sleep600.sh
# Следующая срока определяет имя каталога
# стандартного ввода/вывода
host_directory = /home/pyworker/prog
# Следующая срока определяет необходимое число
# процессоров для выполнения задачи
# Если указывается значение any, то число процессоров
# должно быть определено при старте задачи
#cpu_count = 1
really_cpu = 1
cpu_count = 8
# Следующая строка - название секции
# Секция не обязательная
home_number =
system = default
run_number = 2
user = ivan
group = users
job_id = 474
task_directory = /common/runmvs/tasks/pyworker.sleep600.sh.2
restore_mode = no
[TimeRequest]
# Время (по максимуму), необходимое для выполнения задачи,
# указывается в минутах
limit = 5
# количество повторов задачи
#repeat_times =
# значение кванта, указывается в минутах
# если указать 0, то квант игнорируется (задача не фоновая)
quant = 0
#
term_time = 0
term_signal = 123
repeat_times = 1
unlimited = no

[Redirections]
stdin=
stdout=
stderr=
interactive=no
[Globus_Conf]
globus_id=
[Locals]
[Batch]
code : "
    #!/bin/bash
    export HISTCONTROL="ignoredups"
    export HISTSIZE="1000"
    export HOME="/home/pyworker"
    export HOSTNAME="node1199.eth0.mvs50k.jscc.ru"
    export LANG="ru_RU.UTF-8"
    export LESSOPEN="||/usr/bin/lesspipe.sh %s"
    export LOGNAME="pyworker"
    export LS_COLORS="rs=0:di=01;34:ln=01;36:mh=00:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=40;33;01:cd=40;33;01:or=40;31;01:mi=01;05;37;41:su=37;41:sg=30;43:ca=30;41:tw=30;42:ow=34;42:st=37;44:ex=01;32:*.tar=01;31:*.tgz=01;31:*.arc=01;31:*.arj=01;31:*.taz=01;31:*.lha=01;31:*.lz4=01;31:*.lzh=01;31:*.lzma=01;31:*.tlz=01;31:*.txz=01;31:*.tzo=01;31:*.t7z=01;31:*.zip=01;31:*.z=01;31:*.Z=01;31:*.dz=01;31:*.gz=01;31:*.lrz=01;31:*.lz=01;31:*.lzo=01;31:*.xz=01;31:*.bz2=01;31:*.bz=01;31:*.tbz=01;31:*.tbz2=01;31:*.tz=01;31:*.deb=01;31:*.rpm=01;31:*.jar=01;31:*.war=01;31:*.ear=01;31:*.sar=01;31:*.rar=01;31:*.alz=01;31:*.ace=01;31:*.zoo=01;31:*.cpio=01;31:*.7z=01;31:*.rz=01;31:*.cab=01;31:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.gif=01;35:*.bmp=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.ppm=01;35:*.tga=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.tif=01;35:*.tiff=01;35:*.png=01;35:*.svg=01;35:*.svgz=01;35:*.mng=01;35:*.pcx=01;35:*.mov=01;35:*.mpg=01;35:*.mpeg=01;35:*.m2v=01;35:*.mkv=01;35:*.webm=01;35:*.ogm=01;35:*.mp4=01;35:*.m4v=01;35:*.mp4v=01;35:*.vob=01;35:*.qt=01;35:*.nuv=01;35:*.wmv=01;35:*.asf=01;35:*.rm=01;35:*.rmvb=01;35:*.flc=01;35:*.avi=01;35:*.fli=01;35:*.flv=01;35:*.gl=01;35:*.dl=01;35:*.xcf=01;35:*.xwd=01;35:*.yuv=01;35:*.cgm=01;35:*.emf=01;35:*.axv=01;35:*.anx=01;35:*.ogv=01;35:*.ogx=01;35:*.aac=01;36:*.au=01;36:*.flac=01;36:*.mid=01;36:*.midi=01;36:*.mka=01;36:*.mp3=01;36:*.mpc=01;36:*.ogg=01;36:*.ra=01;36:*.wav=01;36:*.axa=01;36:*.oga=01;36:*.spx=01;36:*.xspf=01;36:"
    export MAIL="/var/spool/mail/pyworker"
    export OLDPWD
    export PATH="/common/runmvs/bin:/usr/runmvs/bin:/common/runmvs/sbin/:/usr/local/bin:/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/home/pyworker/.local/bin:/home/pyworker/bin"
    export PWD="/home/pyworker/prog"
    export SHELL="/bin/bash"
    export SHLVL="2"
    export TERM="screen"
    export USER="pyworker"
    export XDG_SESSION_ID="777"
    EnvCommandLine=(
    )
    num_nodes=1
    hosts_list="$2"
    exitstatus_file="$3"
    prefix="$5"
    task_image="$4"
    np=1
    tview_flag=
    progname="$5 /home/pyworker/prog/sleep600.sh"
    mpich_args=""
    cmdLineArgs=" -maxtime 20 -np 2"
    width_distribution=0
    numofnodes=1
    proc_per_node=


    MPIRUN_HOME=/common/mvapich/bin
    # cd "/home/pyworker/prog"

    if [  "" ] ;then
      machine_file=`mktemp /tmp/machinefile.XXXXXX` || exit 1
      /common/runmvs/bin/confread $task_image Machinefile > $machine_file
      gentmpname=`mktemp /tmp/machines.XXXXXX` || exit 1
      /common/runmvs/bin/genmachinefile "$hosts_list" $machine_file 1 >$gentmpname
      hosts_list=$gentmpname
      rm -f $machine_file
    fi

    trap ' if [ "" ] ; then   rm $gentmpname ;fi ; exit '  1 2 3 15


    EnvCommandLine=(  "${EnvCommandLine[@]}" MACHINEFILE_NAME=$hosts_list )
	export LMUTIL=lmutil


    if [ x = x-totalview ]
    then
	if ! check_license -c /common/totalview/license.dat -f TV/Base
	then
	    sleep 1
	    echo 215 >$exitstatus_file
	    exit 215
	fi
    fi
    (

    . /common/runmvs/bin/run-mvapich-ib

    )
    exitstatus=$?

    if [ 0 -ne 0 ] ; then
	exitstatus=215
    fi


    if [ "" ] ; then   rm $gentmpname ;fi
    echo $exitstatus >$exitstatus_file
    exit $exitstatus

    "
[Queue]
queue_dir = /usr/runmvs/users/pyworker/queue
start_time =

[TaskNodes]
[Nodes]
node1193=8
node1182=4
node2=3

[Docker]
docker_image_file=/home/ivan/mvapich.tar
docker_image=ivister/mvapich:latest
docker_command="mpirun -np 5 --hostfile /home/ivan/hst ./hw 1> ~/out 2> ~/err"

[Containers]
node1193 = 474-node1193
node1182 = 474-node1182
node2 = 474-node2