Add class for main object in the simulation

Class parameters:
- shared ptr na siec neuronową
-  vector objektów typu kończyn (ref lub wskaźnik dla kończyn)
-  żołądek : narząd 
-  serce : narząd
- joint -> weak_ptr na część ciała z której wyrasta i shared_ptr która z niego wyrasta  (mogą być id-ki)
- hp level