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加氢的问题? #14

@CCSU-Wine

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@CCSU-Wine

您好、非常感谢能提供这样一个模型,在使用模型的时候,我发现了几个问题,有点疑惑,所以冒昧来请教一下您。
1、我使用prolif统计了训练数据集中能获取到的IFP边,只有Hydrophobic、PiStacking、Anionic、CationPi、PiCation这几种作用力被当成一种边作为特征输入给模型,而氢键并没有当成一种边输入到模型中,这是因为数据集中的配体和受体本身就不含H所以没有获取到还是因为氢键这种作用力是被当成模型需要学习的对象?
2、我使用了大概400个蛋白质以及对应的配体,让模型分别对这400个蛋白质及配体的构象分别进行评分,测试的结果看起来并不理想,评分结果中大于0.5分的占比一半都不到,这看起来就像抛硬币。我测试了官方模型权重在测试集上的性能,test_acc的指标值大约为91%,其它的测试指标也很优秀。所以、能否给出一个详细的测试流程来帮助达到模型所应达到的性能。

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